1999年9月，根据《中华人民共和国人民防空法》和省国防动员集训会议的精神，我市设立了人民防空办公室，为市政府办公室正科级内设机构，人员编制3名。
　　2000年11月，第四次全国人民防空会议在北京召开，我市被国务院、中央军委确定为全国人防重点城市。2001年8月，中共汕尾市委、汕尾市人民政府下发《汕尾市市级党政机构改革实施意见的通知》（汕委〔2001〕18号），批准人防办由原挂靠政府办正科级单位升格为单独设置的正处级行政单位，是国防动员委员会的常设办事机构，也是市政府人民防空工作的主管部门，简称为“市人防办”，内设综合科和工程科两个职能科，机关编制9名。2003年5月，按照省的有关规定和我市人防事业发展的要求，市编委批准成立了市人防通信站，为市人防办下属正科级事业单位。各县（市、区）均已按要求设置了人防机构，配备了领导班子，人员到位。